核心提示:該研究在金魚中成功建立基于CRISPR/Cas12a系統(tǒng)的基因編輯系統(tǒng),首次實現(xiàn)該系統(tǒng)在非模式魚類中基因組中的高效編輯,揭示了溫度可作為CRISPR/Cas12a編輯效率的開關,實現(xiàn)不同發(fā)育窗口的可控性條件基因敲除?!ㄊ澜缡称肪W(wǎng)-)
CRISPR/Cas技術自誕生以來,在農(nóng)業(yè)、醫(yī)藥和食品安全等多個領域取得了革命性進展。作為一種源于細菌和古細菌的適應性免疫機制,CRISPR/Cas系統(tǒng)通過識別并切割外源DNA,從而防御病毒和質(zhì)粒的入侵。隨著該技術的不斷發(fā)展,CRISPR/Cas系統(tǒng)已經(jīng)被廣泛應用于基因編輯,并在不同物種中取得了顯著成果。特別是CRISPR/Cas12a(Cpf1)系統(tǒng),其結(jié)構簡單、功能多樣,使其成為繼CRISPR/Cas9之后,基因編輯領域的另一重要工具。然而,CRISPR/Cas12a的應用僅僅限制于哺乳動物中或一些模式物種中,還未實現(xiàn)在非模式物種尤其是冷溫性動物中的應用。朱華研究員團隊系統(tǒng)性地評估了兩種CRISPR/Cas12a變體(LbCas12a和AsCas12a)在不同溫度和不同時間窗口下對酪氨酸酶(tyr)基因的編輯效果。研究結(jié)果表明Cas12a具有較強的溫度依賴性,尤其是AsCas12a在高溫條件下展現(xiàn)出明顯增強的編輯活性。僅通過一小時的短時高溫處理,便能實現(xiàn)有效的基因敲除,充分證明了CRISPR/Cas12a作為一種高效、快速的基因編輯工具的潛力。此外,溫度作為條件性觸發(fā)因子,能夠精確調(diào)控金魚胚胎發(fā)育過程中的基因敲除時機,為基因編輯的時空調(diào)控提供了新的策略。全基因組重測序結(jié)果進一步驗證了所獲得的突變體未出現(xiàn)脫靶效應,進一步確立了該技術的精準性和高效性。
本研究表明,CRISPR/Cas12a系統(tǒng)能夠作為CRISPR/Cas9系統(tǒng)的有效補充,尤其在溫度變化條件下具有更高的應用價值,極大擴展了基因編輯技術的應用范圍和潛力。此項技術不僅為金魚功能基因組學研究提供了高效的工具,也為水產(chǎn)養(yǎng)殖領域的基因編輯提供了新的技術支撐,并為低溫環(huán)境下的基因編輯提供了可行的解決方案。金魚CRISPR/Cas12a編輯技術的建立推動了水產(chǎn)養(yǎng)殖物種遺傳改良的技術革新,彰顯了基因編輯技術在水產(chǎn)動物育種中的廣泛應用前景。
水產(chǎn)所為論文第一完成單位,觀賞魚研究室李繪娟博士為第一作者,朱華研究員為通訊作者。該研究得到了北京市鄉(xiāng)村振興農(nóng)業(yè)科技項目(NY2401170024)、北京市農(nóng)林科學院院青年科學基金(QNJJ202238)、北京市農(nóng)林科學院院科技創(chuàng)新能力建設專項(KJCX20230216)等項目支持。